지원사업
학술연구/단체지원/교육 등 연구자 활동을 지속하도록 DBpia가 지원하고 있어요.
커뮤니티
연구자들이 자신의 연구와 전문성을 널리 알리고, 새로운 협력의 기회를 만들 수 있는 네트워킹 공간이에요.
초록· 키워드
오류제보하기
진핵세포의 유전자 발현은 genomic DNA 부위의 프로모터라고 불리우는 지역에 전사인자와 RNA 중합효소가 자리하면서 시작되는 기작이다. 유전자 내의 프로모터를 동정하는 여러종류의 실험 방법들이 있지만, 많은 시간과 노동력이 요구되어진다. 본 연구에서는 Ensembl, NCBI, CpG plot 등과 같은 생물정보학 관련 프로그램들을 활용하여 SETDB1 유전자의 프로모터를 동정하여 클로닝하고자 하였다. PCR 증폭을 수행한 후 얻은 약 2 kb DNA 조각을 SETDB1-P1이라 명명하였으며, PCR 산물은 TA 벡터로 클로닝 후 확인하였으며, 이를 다시 제한 효소 절단을 통하여 pGL3-luc 벡터로 클로닝하였다. 클로닝된 pGL3-SETDB1-P1-luc 플라스미드를 H1299 폐암세포주에 transfection 시킨 후 여러 가지 항암제를 처리하였을 때, taxol, 5-FU, doxorubicin 처리군에서 SETDB1 프로모터 활성이 감소하는 것을 확인하였다. 이러한 결과는 웨스턴 블롯 및 RT-PCR 실험을 통해 항암제 처리 후 SETDB1 유전자 발현이 조절됨을 확인하였다. 그러므로 bioinformatics 프로그램을 통한 프로모터 동정 및 클로닝 방법을 다른 유전자들에도 적용시킨다면, 유전자 발현 연구에 매우 유용할 것으로 사료된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과
고찰
References
초록
참고문헌 (19)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - Barrero, M. J / 2012 / The RNA polymerase II transcriptional machinery and its epigenetic context / Subcell Biochem 61 : 237 ~ 259
2. [학술지(정기간행물)] - Bonizzoni, P / 2005 / ASPIC : a novel method to predict the exon-intron structure of a gene that is optimally compatible to a set of transcript sequences / BMC Bioinformatics 6 : 244 ~
3. [학술지(정기간행물)] - Ceol, C. J. / 2011 / The histone methyltransferase SETDB1 is recurrently amplified in melanoma and accelerates its onset / Nature 471 : 513 ~ 517
4. [학술지(정기간행물)] - Chatterjee, R / 2012 / CpG methylation recruits sequence specific transcription factors essential for tissue specific gene expression / Biochim Biophys Acta 1819 : 763 ~ 770
5. [학술지(정기간행물)] - Cho, S / 2012 / Dynamics of Setdb1 expression in early mouse development / Gene Expr Patterns 12 : 213 ~ 218
2. [학술지(정기간행물)] - Bonizzoni, P / 2005 / ASPIC : a novel method to predict the exon-intron structure of a gene that is optimally compatible to a set of transcript sequences / BMC Bioinformatics 6 : 244 ~
3. [학술지(정기간행물)] - Ceol, C. J. / 2011 / The histone methyltransferase SETDB1 is recurrently amplified in melanoma and accelerates its onset / Nature 471 : 513 ~ 517
4. [학술지(정기간행물)] - Chatterjee, R / 2012 / CpG methylation recruits sequence specific transcription factors essential for tissue specific gene expression / Biochim Biophys Acta 1819 : 763 ~ 770
5. [학술지(정기간행물)] - Cho, S / 2012 / Dynamics of Setdb1 expression in early mouse development / Gene Expr Patterns 12 : 213 ~ 218
이 논문의 저자 정보
이 논문과 함께 이용한 논문
식물의 물부족 스트레스 신호 전달 네트워크에 대한 이해
이재훈
생명과학회지
2018
.03
구리-오염 토양에서 토마토 식물의 생장과 스트레스-관련 유전자 발현에 미치는 구리-내성 Pseudomonas의 영향
김민주
,
송홍규
미생물학회지
2017
.12
단백질합성인자 eIF5B의 저 발현 효모벡터의 제조 및 특성
최상기
,
송진희
,
이준행
외 2명
미생물학회지
2004
.03
아데노바이러스 유전자치료벡터의 생식독성 연구
이규식
,
곽승준
,
김순선
외 7명
미생물학회지
2007
.09
ErbB 수용체를 이용한 난소암세포 표적 유전자치료 벡터의 개발
정인실
,
방성호
미생물학회지
2011
.03
최근 본 자료
댓글(0)
0
UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2015-400-001294196