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학술저널
저자정보
정희 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644) 이재복 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644) 길진수 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644) 엄유리 (Forest Medicinal Resources Research Center National Institute of Forest Science Yeongju 36040 Korea) 김지현 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644) 황민영 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644) 김호방 (Life Sciences Research Institute Biomedic Co. Ltd. Bucheon 14548 Korea) 홍창표 (Theragen Etex Bio Institute Theragen Etex Suwon 16229 Korea) Shin Gi Park (Theragen Etex Bio Institute Theragen Etex Suwon 16229 Korea) 심동환 (Department of Forest Genetic Resources National Institute of Forest Science Suwon 16631 Korea) 이이 (Department of Industrial Plant Science & Technology Chungbuk National University Cheongju 28644)
저널정보
한국육종학회 Plant Breeding and Biotechnology Plant Breeding and Biotechnology Vol.7 No.1
발행연도
2019.1
수록면
67 - 71 (5page)

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Simple sequence repeat (SSR) markers were developed from Pinus densiflora, a species native to Asia, to investigate its genetic diversity and population structure in order to provide information for the management and breeding of this species. Using next-generation sequencing, a total of 1,008 putatively polymorphic SSR primer sets were designed. Seventeen polymorphic SSR markers in 121 individuals belonging to four natural populations of P. densiflora were identified and characterized, with three to seventeen alleles per locus. The expected heterozygosity ranged from 0.1844 to 0.8731 in four populations, and the average of the PIC values ranged from 0.2789 to 0.8488. Cross amplification of these markers was performed among the related species P. rigida, P. koraiensis, P. parviflora, and P. bungeana. The developed novel SSR markers are promising tools for studying the genetic diversity or population structure of P. densiflora and its related species.
#Genetic diversity #Next-generation sequencing #Pinaceae #Pinus densiflora #Simple sequence repeat

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