메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Mohd-Norhadri Mohd-Hilmi (Universiti Sains Malaysia) Marwah Haitham Al-Laila (Universiti Sains Malaysia) Nurul Hashimah Ahamed Hassain Malim (Universiti Sains Malaysia)
저널정보
한국정보처리학회 JIPS(Journal of Information Processing Systems) JIPS(Journal of Information Processing Systems) 제12권 제4호
발행연도
2016.12
수록면
724 - 740 (17page)

이용수

표지
📌
연구주제
📖
연구배경
🔬
연구방법
🏆
연구결과
AI에게 요청하기
추천
검색

초록· 키워드

오류제보하기
The performance issues of screening large database compounds and multiple query compounds in virtual screening highlight a common concern in Chemoinformatics applications. This study investigates these problems by choosing group fusion as a pilot model and presents efficient parallel solutions in parallel platforms, specifically, the multi-core architecture of CPU and many-core architecture of graphical processing unit (GPU). A study of sequential group fusion and a proposed design of parallel CUDA group fusion are presented in this paper. The design involves solving two important stages of group fusion, namely, similarity search and fusion (MAX rule), while addressing embarrassingly parallel and parallel reduction models. The sequential, optimized sequential and parallel OpenMP of group fusion were implemented and evaluated. The outcome of the analysis from these three different design approaches influenced the design of parallel CUDA version in order to optimize and achieve high computation intensity. The proposed parallel CUDA performed better than sequential and parallel OpenMP in terms of both execution time and speedup. The parallel CUDA was 5-10x faster than sequential and parallel OpenMP as both similarity search and fusion MAX stages had been CUDA-optimized.
#Chemoinformatics #Graphical Processing Unit #Group Fusion #Open Multiprocessing #Virtual Screening

목차

등록된 정보가 없습니다.

참고문헌 (26)

참고문헌 신청
J. Gasteiger / 2006 / Chemoinformatics : a new field with a long tradition / Analytical and Bioanalytical Chemistry 384(1):57~64 google schola W. P. Walters / 1998 / Virtual screening : an overview / Drug Discovery Today 3(4):160~178 google schola P. Willett / 1998 / Chemical similarity searching / Journal of Chemical Information and Computer Sciences 38(6):983~996 google schola J. Hert / 2005 / Enhancing the effectiveness of similarity-based virtual screening using nearest-neighbor information / Journal of Medicinal Chemistry 48(22):7049~7054 google schola P. Willett / 2013 / Combination of similarity rankings using data fusion / Journal of Chemical Information and Modeling 53(1):1~10 google schola

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0